生态灭鼠是为了控制鼠害，降低鼠密度，减少鼠害对人类健康和生态环境的危害。

生态灭鼠是鼠害综合治理的重要手段之一，可以降低鼠类种群的环境负荷能力，从而降低其数量，并能使鼠类种群的数量不易恢复。如果不改变环境，只采用毒杀或捕杀等措施，一般只能降低其数量，灭鼠效果只是暂时的。因为鼠类自身繁殖力强，在其种群密度降低的情况下，不但不影响它们所需要的食物和其他资源，反而使平均每个个体的有效食物量和其他资源增加，结果它们的生长加速、性成熟提早、出生率上升面死亡率下降，于是种群增长率提高，种群迅速得到恢复。